大明末年讲述的是明朝天启年间熹宗皇帝朱由校荒于朝政太监魏忠贤独搅大权大肆剿杀异己朝廷危机重重熹宗皇帝无力回天在悲愤中病逝信王朱由检继位改年号崇祯立志改新朝政重振大明无奈朝廷积弊太深加之朱由检生性多疑推新不力虽有一代怀揣绝世武功的英豪陈王廷倾心辅佐也无济于事最终众叛亲离被农民起义军李自成攻破京城崇祯皇帝朱由检空怀一腔治国之心魂归煤山大明王朝灭亡给世人留下了一面历史的镜子
本剧由四宗发生在香港扣人心弦的真实刑案带出四个令人惊惧的罪行藉由一队重案组的警探办案实录贯穿而成包括耸人听闻的「屯门色魔强奸案」喧腾一时的桃色纠纷「溶尸案」使市民提心吊胆的「大圈仔军火械劫案」及「淫业大厦扫黄行动」案件生动地描绘各阶层犯罪的人性丑恶而编剧为了加强剧中人物与案件的关连性特别穿插男女主角CID张兆军林嘉华女CID丁兰蓝洁瑛重案组总督察方伟陶大宇扫黄组女总督察刘婉仪梁婉静及聂志华张国强一段微妙的五角感情关系交错编织成属于都市人性化的实录档案