明真大学附属医院的人气直线下滑濒临破产的危机关头在此时刻干练果敢的医生鬼头笙子夏木玛丽 饰脱去白衣出任明真大学的校长她针对医疗研究等方面进行大刀阔斧的改革并积极引进杰出人才其中就包括医龙队伍的重要成员朝田龙太郎坂口宪二 饰和加藤晶稻森泉 饰以期他们帮助明真完成日本首例小儿心脏移植手术经龙太郎建议各自背负伤痛的藤吉圭介佐佐木藏之介 饰和荒濑门次阿部隆史 饰相继归队加上之前驻守明真伊集院登小池彻平 饰医龙团队黄金阵容全面复活 这群拥有赤诚理想的医者能否达成他们心中的目标
故事讲述石中玉石破天乃自幼失散之孪生兄弟破天与父母失散辗转成为长乐帮主 中玉则自幼受父母溺爱行事只为个人喜恶闯荡江湖期间分别结识叮当铁珊瑚冬儿及侍剑 展开一段五角恋爱 雪山派掌门白自在误会中玉巫害死其孙女白阿秀开声讨大会对付中玉阴差阳错中玉与破天互调身份并展开一段段奇遇及后中玉破天相认同赴侠客岛角开武林高手相继失踪之谜最后二人更同练侠客神功联手对付野心控制武林之贝海石展开连场恶斗……
宋真宗年间秘密筹组的情报组织金龙门门下高手如云卓不凡吴岱融骆孤峰欧瑞伟及韩椎李家声尤为佼佼者三人出生入死屡建奇功辽国二太子耶律修哲为达颠覆中原之目的亦成立紫薇山庄由展聘婷罗慧娟主持婷利用凡之感情介入凡与曲云烟李婉华之间其后凡发现婷之真实身份依然斩情丝与之对抗然婷与哲则因争夺而明争暗斗
